1972 började några invandrarföreningar och två riksförbund, det italienska och det grekiska, att samarbeta.
1981 hade gruppen vuxit till tio riksförbund.
1989 ombildades den informella samarbetsgruppen till en organisation. Ett konstitutionsmöte antog stadgar och riktlinjer för framtida verksamhet. Organisationen fick namnet Samarbetsorgan för invandrarorganisationer i Sverige, SIOS.
1997 antogs Iranska riksförbundet och Kurdiska riksförbundet som medlemmar.
1999 blev Chilenska riksförbundet och Eritreanska riksförbundet medlemmar. Syrianska riksförbundet fick medlemskap 2000 och Somaliska riksförbundet blev medlem 2002.
På Representantskapsmötet 2000 fick SIOS nytt Principprogram. I stadgarna genomfördes en rad ändringar, bland annat ändrade man namnet från “Samarbetsorgan för invandrarorganisationer” till “Samarbetsorgan för etniska organisationer”. Förkortningen SIOS behölls.
På Representantskapsmötet i maj 2002 antog SIOS nya stadgar där man bland annat fastslår att aktivt jämställdhetsarbete är en förutsättning för medlemskap i SIOS. Vidare, gäller konsensusprincipen endast för antagande av nya medlemmar.
År 2005 antogs ny Handlingsplattform och Jämställdhetsplan, stadgarna ändrades så att olika former av medlemskap blev möjligt.
2010 blev Serbiska Ungdomsorganisationen och Turkiska Kvinnoförbundet medlemmar.
2011 blev Somaliska riksförbundet och Yarsan riksförbund medlemmar.
2012 blev Kinesiska riksförbundet och Ukrainska alliansen i Sverige medlemmar.
2022 blev Bangladesh Riksförbundet och Gambiska Riksförbundet medlemmar.